Taxonomie, Traitement, Cibles et Rémission. Identification des mécanismes moléculaires de la non-réponse aux traitements, des rechutes et de la rémission dans des conditions auto-immunes, inflammatoires et allergiques
Financement : Innovative Medicines Initiatives (IMI), Horizon 2020, EC/EFPIA
Durée : 7 ans (2019-2026)
Partenariat : 69 partenaires, 15 pays
Budget global : 80M€
Budget du LBAI : 360 000€
Site du projet
Améliorer la gestion des patients non-répondeurs aux traitements
dans sept maladies à médiation immunitaire
L'enjeu :
Les maladies auto-immunes, inflammatoires et allergiques sont des maladies chroniques courantes qui affectent considérablement le bien-être de millions de personnes dans le monde et représentent un fardeau considérable pour les systèmes de santé. Bien que différents traitements soient disponibles, la réponse et la progression de la maladie chez chaque patient restent imprévisibles.
Actuellement, on en sait encore trop peu sur les bases moléculaires de ces maladies. Afin de pouvoir mieux prédire la réponse au traitement et potentiellement identifier de nouveaux biomarqueurs conduisant à une meilleure gestion des patients et à un traitement personnalisé, il est urgent de mieux comprendre les mécanismes cellulaires à l'origine du développement de chaque maladie.
L'objectif :
Issu d'un effort sans précédent pour réunir des experts de différentes disciplines médicales, des technologies innovantes d'analyses biologiques, de la biologie des systèmes et de la bioinformatique et des spécialistes de PME innovantes et de grandes entreprises pharmaceutiques, 3TR - un projet de partenariat public-privé sous l'égide de l'IMI - a pour objectif d'approfondir nos connaissances des voies moléculaires et des mécanismes liés à la réponse et à la non-réponse au traitement dans sept maladies différentes à médiation immunitaire, allergiques et inflammatoires : le lupus érythémateux systémique, la polyarthrite rhumatoïde, la sclérose en plaques, la maladie intestinale inflammatoire (y compris la colite ulcéreuse et la maladie de Crohn), l'asthme et la maladie broncho-pulmonaire obstructive chronique. Malgré leur hétérogénéité, des études récentes ont montré qu’au niveau moléculaire, certains groupes de patients partageaient certaines caractéristiques de ces maladies, suggérant ainsi qu’ils pouvaient également partager les voies impliquées dans la réponse au traitement ou la progression de la maladie.
Le consortium du projet 3TR propose de mener une analyse moléculaire multidimensionnelle sur plusieurs types d'échantillons recueillis longitudinalement chez des cohortes de patients recrutés de manière homogène. Cette analyse "multi-omique" de haute résolution, réalisée dans des maladies individualisées, devrait faciliter la stratification et l'identification de modèles moléculaires qui permettront de mieux prédire la réponse ou la non-réponse à la thérapie. Un suivi longitudinal prospectif comprendra la collecte de novo de plusieurs types d'échantillons provenant du même individu à plusieurs moments. 3TR testera une série de techniques moléculaires afin de fournir une base de données complète qui sera analysée à l'aide de techniques bioinformatiques et de modélisation avancées. En outre, en utilisant une combinaison de données harmonisées d'études universitaires et d'échantillons provenant d'essais cliniques soutenus par l'industrie, et une nouvelle collecte de données prospectives chez des patients traités par thérapie classique, le principal objectif de 3TR est d'identifier des signatures fiables ainsi que des voies et des mécanismes moléculaires liés à la réponse et à la non-réponse au traitement, en tenant toujours compte des différentes dimensions cliniques de la "réponse".
Les résultats attendus :
Ces méthodes permettront d'identifier les patients susceptibles de rechuter ou d'entrer en rémission. Cette analyse moléculaire détaillée servira de base à l'élaboration de modèles mécanistiques des maladies. Elle aidera également à comprendre les processus en action dans les tissus cibles et les adaptations du système immunitaire, ce qui pourrait fournir une approche entièrement novatrice pour élucider les mécanismes de causalité. Cette approche complète permettra d'identifier de nouvelles cibles potentielles pour les médicaments, d’envisager la réorientation des médicaments et des biomarqueurs. Les troubles auto-immuns, allergiques et inflammatoires étudiés peuvent partager des voies de progression communes ; par conséquent, les sept maladies seront étudiées à la fois en parallèle et conjointement. Dans ce contexte, 3TR aura accès à une quantité sans précédent de données cliniques et à des échantillons de plus de 50 000 patients dans le cadre de 50 essais cliniques, dans le but final de découvrir et de valider des biomarqueurs de stratification pour améliorer la prise en charge des patients.
L'implication du LBAI :
Le LBAI est principalement impliqué dans la partie analytique du projet, en lien avec l'imagerie par cytométrie de masse (WP4 et WP6).
Vidéo de présentation du projet
Ce projet est financé par l'Initiative Technologique Conjointe IMI2, en vertu de l'accord de subvention n°831434 (3TR). L'initiative conjointe est soutenue par le programme européen pour la recherche et l'innovation Horizon 2020 et par l'EFPIA.