La spectrométrie de masse est une technique d'analyse qui permet de déterminer les masses moléculaires des composés que l'on souhaite analyser.  Pour cela, il faut séparer et détecter des ions formés à partir de ces molécules, par une sources d'ionisation différente selon le spectromètre. Le spectre de masse issu de cette étude permet d'obtenir l'intensité des ions en fonction du ratio m/z.

Analyses de : peptides, polyphénols, polylactides mais aussi des composés organiques de synthèse, ou issus d'extraits d'algues ou de plantes halophytes, de polysaccharides, ou de métabolites.

La plateforme dispose de deux équipements complémentaires : un spectromètre Maldi-Tof et un Electrospray à mobilité ionique (le premier installé en Europe).

Le premier permet une ionisation douce sur une gamme de 400 à 15 000 Da minimum, sans effet de fragmentation des composés grâce aux différentes matrices ionisantes utilisés, sous forme de traces mais également multichargés entre 0 et 1 200 Da de préférence. Le complément de mobilité ionique permet d'identifier des molécules de conformations chimiques différentes, pour une masse similaire.